A doença do intestino irritável (DII) é uma patologia crônica que inclui a colite ulcerativa e a doença de Crohn. Os sintomas do doente consistem em episódios crônicos ou recorrentes de dor abdominal e diarreia. As manifestações clínicas de DII não são específicas e os sintomas assemelham-se aos de outras doenças não orgânicas como a síndrome do intestino irritável, sendo necessário efetuar uma endoscopia para confirmar o diagnóstico. A medição não invasiva da calprotectina fecal é considerada uma ferramenta de rastreio útil para a diferenciação entre DII e SII. A calprotectina constitui mais de 60% do total de proteínas no citosol dos neutrófilos, que se infiltram na mucosa intestinal como parte da resposta inflamatória. Consequentemente, as doenças orgânicas do intestino resultam em níveis elevados de calprotectina fecal. A concentração de calprotectina nas fezes reflete o número de neutrófilos presente e fornece um indicador da gravidade da inflamação intestinal. A medição da calprotectina fecal como parte do diagnóstico (e da gestão da doença) de doenças intestinais orgânicas como a DII é um parâmetro em rápido crescimento. O paciente com DII oscila entre as fases ativa (inflamatória) e inativa da doença. Estas fases devem ser consideradas ao interpretar os resultados do teste de calprotectina fecal. Outras doenças intestinais, incluindo muitas infecções gastrointestinais e cancro colorretal, podem resultar em níveis elevados de calprotectina. Um diagnóstico de DII só poderá ser feito correlacionando outros exames de diagnóstico e do estado clínico geral do paciente. A calprotectina fecal é um indicador da presença de neutrófilos nas fezes e não é específica para a DII.